Egy intelligens szökőkút könnyebben kezelhető, ha a vezérlőrendszer világos csoportokra van osztva. A szivattyúknak, lámpáknak, szelepeknek és zenei jeleknek nem szabad egyetlen egyszerű kapcsolóról működniük. Nagy projektek esetén a kezelőnek szüksége lehet egy csendes nappali üzemmódra, egy világosabb hétvégi üzemmódra és egy zenei műsorra az ünnepekre. A PLC-szekrény vagy az érintőképernyő tárolhatja ezeket a programokat, és csökkentheti az ismételt kézi munkát.
A védelmi beállítások is fontosak. A vízszintjelzések, a szivárgás elleni védelem, a túlterhelés elleni védelem és a vészleállítás csökkentheti a berendezés kockázatát a napi használat során. Karbantartáshoz minden szivattyúcsoportnak rendelkeznie kell egy számmal, és a kábel útvonalának meg kell egyeznie a rajzzal. Hiba esetén a személyzet gyorsan megtalálja az érintett zónát, ahelyett, hogy hosszú időre leállítaná az egész szökőkutat. Egy jó irányítási terv teret enged a későbbi programmódosításoknak is, ha a téren új események vannak.
